Apikotomija je oralnohirurška intervencija kojom se uklanja vrh korena zuba i periapikalni proces koji obuhata deo tog korena. Usled infekcije koja dolazi iz nekrotičnog kanala korena, formira se patološki izmenjeno tkivo koje se najčešće locira na samom vrhu korena zuba.  Ova intervencija se naziva još i resekcija korena. Ove promene se u velikom broju slučajeva dešavaju na endodontski nezbrinutim zubima kao i na zubima koji su neadekvatno lečeni.

Pre samog uklanjanja vrha korena zuba neophodno je sprovesti endodontski tretman na zahvaćenom zubu. Na tako pripremljenom zubu se izvodi hirurška intervencija gde se posebnim borerima uklanja vrh korena zuba a potom i mali deo patološki izmenjenog tkiva. Poželjno je da se šupljina u kosti nastala operativnim postupkom ispuni koštanim zamenikom (veštačkom kosti) i na taj način omogući potpuno koštano zarastanje.

U slučajevima kada se intraoperativno ili preoperativno dijagnostikuje fraktura korena, ili je pak lokalizacija patološkog procesa ili resorpcije korena teško dostupna, vrši se ekstrakcija (vađenje) zahvaćenog zuba koji se kasnije nadoknađuje implantatom ili nekim od protetičkih metoda.